الهم الاكبر الذي يؤرق مخططي المدن الضخمة هو الماء بشقيه العادم الناتج من البيوت والمصانع والعذب الناتج عن مياه الامطار او ذلك الذي يفيض من الانهار .في طوكيو قامت الحكومة اليابانية بعمل
مشروع ضخم تحت الارض عبارة عن مستوعبات ضخمة تنفتح عند الفيضان وتضخ الماء بعدها عن انحسار النهر وانقطاع المطر. هذه المستوعبات الضخمة تدعي المستوعبات-جي بدأ العمل بها في العام 1992 وانتهى 2009 وكلف 2 بليون دولار لكنه
سيطر على الانهار الاربعة التي تخترق طوكيو وكذلك مياه الامطار الموسمية التي تضرب المدينة .كل شيء في المشروع ضخم من المستوعبات الى اماكن الضخ.